Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms