Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms