Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2B3Q16720 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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