Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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