Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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