Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms