Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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