Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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