Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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