Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF6Q15052 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms