Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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