Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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