Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD4Q14839 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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