Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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SEMA3AQ14563 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA3AQ14563 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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