Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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