Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms