Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms