Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms