Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB2AQ13885 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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