Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTB1Q13884 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms