Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
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SHROOM2Q13796 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHROOM2Q13796 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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