Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL4AQ13619 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4AQ13619 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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