Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms