Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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