Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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