Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SP140Q13342 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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