Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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