Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2BQ13224 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
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