Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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