Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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