Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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