Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRIM32Q13049 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM32Q13049 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRIM32Q13049 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TRIM32Q13049 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM32Q13049 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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