Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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