Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms