Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BPTFQ12830 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
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