Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms