Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS3BPQ08380 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms