Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms