Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LRP1Q07954 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms