Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms