Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPCQ03188 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms