Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms