Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MC1RQ01726 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MC1RQ01726 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms