Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms