Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms