Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBA52P62987 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms