Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms