Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXG1P55316 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXG1P55316 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms