Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23AP54725 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms