Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms